Ketua MUI bidang dakwah Muhammad Cholil Nafis menyebut pemetaan masjid yang dilakukan Polri terkait radikalisme menyinggung perasaan Umat Islam karena masjid tempat yang sakral. MUI menegaskan tidak perlu ada pemetaan terhadap masjid, tetapi penceramahnya yang perlu dipetakan kalau memang ada.
Cholil Nafis juga menyebut jika ingin mencegah radikalisme jangan hanya di masjid, tapi rumah-rumah ibadah. Hindari diksi Polri hanya membidik umat Islam saja atau dugaan bahwa umat Islam yang menjadi sasaran.